قال ابن رافع في "معجمه" -نقلًا-: وكان مرض مرضة طويلة نحو سنة ونصف، وتغير ذهنه فيها. وتوفي يوم الخميس ثاني عشرين رجب من سنة عشرين وسبعمائة بالقاهرة، ودفن بمقبرة باب النصر. انتهى (^١).

(^١) "نهاية الاغتباط": [ص ٣٨٠].

وقال الذهبي في "تدكرة الحفاظ" [٤/ ١٥٠٥]: وسمعت من المُحدّث العالم العدلي المفيد كاتب "الحكم" شرف الدين يعقوب بن أحمد بن الصابوني روى عن أحمد بن علي الدمشقي، والنجيب، وابن علاق، وابن أبي الخير، وخلق، ونسخ الأجزاء وساد في الشروط، مات بمصر في سنة عشرين وسبع مائة عن ست وسبعين سنة رحمه الله تعالى.