عام ١٣٨٥هـ انتقل إلى الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة؛ واستمرّ بالتدريس فيها إلى عام ١٤٠٧هـ؛ وقد أشرفَ خلالَها على عددٍ كبيرً من الرسائل العلمية المقيدة لنيل درجتي الماجستير والدكتوراه في كلٍّ من قسمي العقيدة وعلوم الحديث.
وقد خلّف الشيخ "رحمه الله تعالى" وراءَه تصانيف كثيرة، وتعاليق مفيدة في الفروع والأصول، كمل منها جملة وطبعت وجملة كثيرة كملها، ولكنها لم تطبع بعد. يسّر اللهُ إخراجَها لعموم الانتفاع بها؛ ومن بعض مؤلفاته المطبوعة:
١ـ "بلغية القاصي والداني في تراجم شيوخ الطبراني".
٢ـ "رفع الأسى عن المضطر إلى رمي الجمار بالمسا".
٣ـ "رفع الاشتباه عن حديث من صلى في مسجدي أربعين صلاة".
٤ـ "تحقيق القول في حديث: "من مضت عليه خمسة أعوام أو أربعة أعوام وهو غني ولم يحج ولم يعتمر".
٥ـ "كشف الستر عما ورد في السفر إلى القبر".
٦ـ "الإعلان بأن لعمري ليست من الأيمان".
٧ـ "عقيدة الإمام أبي الحسن الأشعري".
٨ـ "الأجوبة الوفية على أسئلة الألفية".
٩ـ "فتح الوهاب فيمن اشتهر من المحدثين بالألقاب".
١٠ـ "إتحاف ذوي الرسوخ بمن عرف بالتدليس من الشيوخ".
١١ـ "يانع الثمر في مصطلح أهل الأثر".
١٢ـ تحقيق "ديوان الضعفاء" للذهبي.