أولا: في أصول الدين
كتاب الدعامة في الإمامة، طبع بعنوان (نصرة المذاهب الزيدية) ثم بعنوان (الزيدية) منسوبا للصاحب بن عباد تحقيق د. ناجي حسن، ويؤكد المولى العلامة مجد الدين المؤيدي أن المحقق أخطأ في العنوان وفي نسبته إلى صاحبه، وأنه قد قام بمقابلة النسخة المطبوعة على الأصل المخطوطة (الدعامة) مؤكدا نسبته إلى الإمام أبي طالب يحيى بن الحسين مع وجود أخطاء مطبعية كثيرة في كتاب المحقق.
كتاب (المبادئ) مبادئ الأدلة في الكلام.
زيادات شرح الأصول ذكره صاحب الحدائق الوردية.
شرح البالغ المدرك، تحقيق محمد يحيى سالم عزان، طبع مؤخرا.
ثانيا: في أصول الفقه وفروعه
كتاب (المجزي) مجلدان وهو من المراجع الهامة في أصول الفقه.
جوامع الأدلة.
(التحرير) في فقه الإمام الهادي عليه السلام وشرحه اثني عشر مجلدا، طبع مؤخرا في مجلدين بتحقيق الأستاذ محمد يحيى سالم عزان - نشر دار التراث بصعدة 1998م.
صفحة ٨٠