ثم صدر أمر عال من سبعة وستين بندا، أيام خير الدين، نظم أمور المعهد في شيء من التفصيل، وتناول العلوم التي تدرس بالمعهد، والكتب التي تشرح، وحقوق الطلبة والمدرسين والمشرفين، وواجباتهم، وكذلك شئون المكتبة.

ثم بدت رغبة في إصلاح هذه النظم، وتعديل الأمر العالي السابق، فصدر أمر آخر في 16 سبتمبر سنة 1912م، من واحد وثمانين بندا، وبعض الملاحق، ويسير المعهد على هديه إلى الآن، وفي هذا القانون آثار من النظم التربوية العتيقة، ووصايا تحث على الاستقامة وحسن الخلق، وتحريم الشك في السنن التي خلفها السلف من العلماء، وتدرس في المعهد علوم تزيد وتختلف عن العلوم التي قرر دراستها في الأزهر عام 1872م، وقد نص على هذه المواد التي تدرس في الجامع الكبير، في البند الأول من الأمر العالي، وهي:

التفسير، الحديث، التوحيد، القراءات، والتجويد، المصطلح، السير، أصول الفقه، الفقه، الفرائض، التصوف، الميقات، النحو والصرف، المعاني والبيان، اللغة والإنشاء والأدب، التاريخ والجغرافيا، الرسم والخط، العروض، المنطق وأدب البحث، الحساب والهندسة، الهيئة، المساحة.

وأدت روح المحافظة الجامدة، وطرق التربية العتيقة المتبعة في الجامع الكبير، إلى الوقوف في سبيل كل تقدم في العلوم الدنيوية، وكل اجتهاد في العلوم الدينية، واقتصر تدريس الجغرافيا والتاريخ على كتابي رقم الحلل لابن الخطيب، ومقدمة ابن خلدون، مع استيعاب خلاصة للتاريخ الإسلامي. أما الهندسة فهي الهندسة الإقليدية، وتدرس في كتاب الطوسي.

ومراحل التعليم ثلاث، ويعقد امتحان للانتقال من مرحلة إلى أخرى، وفيما يلي بيان بالكتب المقررة في الدين واللغة لطلبة المرحلة النهائية، كما نص على ذلك في المادة الرابعة.

التفسير:

أسرار التنزيل للبيضاوي، تفسير الجلالين.

الحديث:

الموطأ مع شرح الزرقاني، صحيح البخاري وتفسير القسطلاني، صحيح مسلم وشرح الأبي، الشفاء للقاضي عياض، وشرح الشهاب الخفاجي.

السير:

Bog aan la aqoon