بأبواب وتراجم كثيرة فاتت المتأخرين الذين جمعوا في كتبهم مؤلفات المتقدمين كالحافظ الذهبى في المشتبه، وابن ناصر في توضيح المشتبه، والحافظ ابن حجر في التبصير. وهذه بعض الأبواب التي فاتتهم: باب إبرويه وأفروية، وباب بُجْدان، وباب بُدَيْح، وباب بذال ونَزَّال، وباب جَعْدَة وحَفَدَة، وباب جَعُونة وجُعْدُبة، وباب جُمَّع، وباب جُنْدب وخِنْدف، وباب الجوائز والحوافر وغير ذلك.
أمَّا التراجم التى يذكرها الحافظ ابن نقطة تحت الأبواب، فكثيرًا منها يحذفونها أو يذكرون بعضها ويحذفون بعضها وذلك بيِّن بالمقارنة مع هذه الكتب. هذا ما أردت أن أذكر بعض ميزات ومحاسن هذا الكتاب العظيم.
بعض الأوهام التي وقع فيها المؤلف:
لبيان الواقع وحق دراسة الكتاب ينبغي أن أذكر هنا أنه طَغَى قلم المؤلف، فوقع في أوهام نادرة في بعض الأسماء، وقد نبهت على ذلك في الحاشية، وفيما يلي أذكر بعض الأمثلة على ذلك:
١ - ذكر الحافظ ابن نقطة بعد أن ضبط "التُّوني" فقال: أبو جعفر محمد ابن طريف التّوني من أهل تُونة.
ويبدو أنه وهم فيه أو هكذا في نسخته في تاريخ نيسابور للحاكم لأنه نقله منه ولعل الصواب في نسبته "البوني" بفتح الباء الموحدة منسوب إلى بَوْن قرية قريبة بهراة، وقد ذكر السمعاني في الأنساب ٢/ ٣٦٣ في "البوني" بفتح الباء الموحدة وسكون الواو أبا عبد الله محمد بن بشر بن بكر البوني الفقيه من بون، يروى عن أبي جعفر محمد بن طريف البَوْني، وقال ياقوت في معجم البلدان ٢/ ٥١٢ "بون" بفتحتين ..