- رئيس الكتاب [٧٣٣] (٢٧٢ ورقة، بدون تاريخ، كتبها موسى بن أحمد).
- أيا صوفيا [٣٧٠٠] (١٩٦ ورقة، كتبها موسى بن محمد علي الشافعي).
- شهيد علي باشا [٢٠٦٣] (١٦٥ ورقة، بدون تاريخ).
- بغداد لي وهبي [١٣٦٧/ ١] (١٠٩ ورقة، بدون تاريخ).
- رشيد أفندي [١٢٥١] (١٥٦ ورقة، بدون تاريخ).
- رشيد أفندي [٢١٤٧٦] (١٠٩ ورقة، بدون تاريخ).
- رشيد أفندي [٦٩٦/ ١] (ق ١ أ-٨٧ ب، من القرن الحادي عشر).
- الجامعة النظامية بحيدر آباد [طب ١] (٢٦٦ ورقة، بخط حديث).
(ب) الطبعات:
- حلب: المطبعة العلمية، ١٩٢٨ م.
- تحقيق: عبد الغني عبد الخالق، ووضع التعليقات الطبية: عادل الأزهري ومحمود فرج العقدة، ط ١. القاهرة: دار إحياء الكتب العربية، ١٣٧٧ هـ/ ١٩٥٧ م، ٣٣٤ ص. [وصدرت لها طبعات مصورة مرارًا].
- نشره: عبد المعطي أمين قلعجي، ط ١. القاهرة: دار التراث، ١٣٩٨ هـ/ ١٩٧٨ م، ٤٦٤ ص، ط ٢. القاهرة: دار التراث، ١٤٠٢ هـ/ ١٩٨٢ م، ٤٦٤ ص، ط ١٤. الرياض: دار عالم الكتب، ١٤١٨ هـ/